机器学习和生物信息学实验室联盟
标题:
ggplot2:基于R语言的骨灰级作图工具
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作者:
shixiang
时间:
2017-1-7 22:28
标题:
ggplot2:基于R语言的骨灰级作图工具
ggplot2,在数据作图方面(
也只擅长带数据的统计绘图,流程图用viso更合适!
),应该是大名鼎鼎了,它支持R语言和Python语言(但对Python语言的支持好像没有R全面)。其最大的优点就是作图美观。默认的几套图色主题已经足够使用,用户需要做的集中精力思考数据内容的高质量可视化。
ggplot2的绘图思路与Photoshop相近,蕴含图层思想,即一幅图由多个半透明图层叠加形成,这样做的好处是便于快速修改某一图层而不影响全局,从而能够达到复杂的作图效果。
ggplot2的绘图风格偏向小清新,但也可偏向学术;matlab则完全偏向学术,python的matplotlib则稍逊于外观。下面放几幅效果图感受ggplot2的画风:
[attach]3412[/attach][attach]3413[/attach][attach]3414[/attach][attach]3415[/attach][attach]3416[/attach][attach]3417[/attach][attach]3418[/attach][attach]3419[/attach][attach]3420[/attach][attach]3421[/attach][attach]3422[/attach][attach]3423[/attach][attach]3424[/attach]
注明:以上图片来自知乎答案:
https://www.zhihu.com/question/21664179
------------------------------ 我的示例分割线------------------------------
安装R和R-studio,然后输入命令:install.packages("ggplot2")直接就开始安装。
官方的API文档:
http://docs.ggplot2.org/current/index.html
,注意由于ggplot2版本更新较快,语法也有大变化,所以学习者要严格参考API文档。
安装完后,进入官网的API文档,我照着写了一段,对之前做的一个实验,维度搜索寻优的数据进行绘制,我想对比与我用excel绘制的效果(已尽力),R的源码如下:
library(ggplot2) # 引入ggplot2包
Data <- read.delim("E:/R/searchBestDimension.txt") # 读入数据,列与列之间用制表符,空格符分割都可以
# 图层叠加,第一层ggplot函数是载入数据Data,aes是指定横轴是dimension列数据,纵轴是rate列数据
# 第二层是散点图层,指定了散点的颜色,透明度;aes(size = rate))是按照rate值绘制大小,动态滴
# 第三层指定x轴和y轴坐标
# 第四层指定x轴最小值,最大值,间隔
# 第五层指定y轴小数以百分比形式显示,还有最小值,最大值,间隔
# 第六层指定坐标轴文字大小和坐标轴标题文字大小
ggplot(Data, aes(dimension,rate)) +
geom_point(color="#D86A6C", alpha=1, aes(size = rate)) +
labs(x="Dimension", y="AP value") +
scale_x_continuous(breaks=seq(10, 350, 30)) +
scale_y_continuous(labels = scales::percent, breaks=seq(0.60, 0.76, 0.01)) +
theme(axis.text=element_text(size=20), axis.title=element_text(size=20))
复制代码
两个图的对比如下,依次是excel画的和ggplot2画的(我是觉得改进挺明显的、、、矢量图看着更赞):
[attach]3426[/attach][attach]3427[/attach]
附数据如下:
dimension rate
10 0.7468
20 0.7578
30 0.7578
40 0.7550
50 0.7479
60 0.7454
70 0.7419
80 0.7428
90 0.7390
100 0.7282
110 0.7240
120 0.7212
130 0.7190
140 0.7154
150 0.7133
160 0.7132
170 0.7143
180 0.7154
190 0.7150
200 0.7059
210 0.7041
220 0.7041
230 0.7026
240 0.7023
250 0.7017
260 0.7013
270 0.7008
280 0.7001
290 0.7007
300 0.7006
310 0.7004
320 0.7003
330 0.6999
340 0.6995
复制代码
作者:
zouquan
时间:
2017-1-16 13:01
赞!这玩意在linux下用还是windows下面用?
作者:
shixiang
时间:
2017-1-18 23:03
zouquan 发表于 2017-1-16 13:01
赞!这玩意在linux下用还是windows下面用?
都可以~ggplot2是基于R语言的包,只要装了R语言,linux,windows,mac都可以~
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