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标题: 生物信息学基础读物 [打印本页]

作者: zouquan    时间: 2011-3-9 21:35
标题: 生物信息学基础读物
1. <生物信息学札记>,这本书比较基础,涉及的生物、算法都比较简单,建议最先阅读。
下载地址:http://ibi.zju.edu.cn/bioinplant/courses/Bioinformatics_note_V.2.htm
2. 清华大学暑期学校视频教程。http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/GSSBC07/
这个教程非常好,刚开始看可能会有些难,建议多看几遍。(如果不是教育网,可能会卡,或连不上)
重点推荐:SS01SS07SS12Runsheng ChenXuegong Zhang: The Applications of Pattern Recognition in Bioinformatics with Several Examples
另外,其他的讲座也不错,但是可能会难一些。
3. 《计算分子生物学导论》,这本书我觉得偏算法、偏难,而且研究的的课题有些老。不过里面的思路对研究很有启示,就是可能会花费很长时间来读。
4. 书有一本《生物信息学与功能基因组学》http://0.book.baidu.com/weilan/m0/w86/h1/4b0fbc2c5b8f.1.html
这本书讲的较好,但是比较贵(将近100元)。
    最后提一点建议:这东西跟学编程序差不多,看书总是浮于表面的。设定一个任务,在完成的过程中查找、学习,效果会更好。


作者: xmubingo    时间: 2011-3-11 22:10
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<生物信息学札记>有第三版http://ibi.zju.edu.cn/bioinplant ... rmatics_note_V3.htm
作者: terence    时间: 2011-7-18 19:07
本帖最后由 terence 于 2011-7-18 19:11 编辑

我也来推荐三本,一本waterman的《Introduction to Computational Biology》,水侠在序列分析领域做了非常多的奠基性的工作,这本书介绍了序列分析,尤其是统计分析的主要思想。
另一本是Richard Durbin的《Biological sequence analysis:probabilistic models of proteins and nuclei acids》,这本书是我最爱不释手的,Durbin是下一代测序领域非常重量级的领袖,尤其他的弟子Heng Li更是与他做了很多开创性的工作。这本书从动态规划入手,然后扩展至有限状态机,再进一步发展到HMM,非常系统的介绍了HMM建模的思想。学会了动态规划和HMM的精髓,基本上可以在Bioinfo领域做出很有影响力的工作。
第三本是《Algorithm on sequence》这本书讲了suffix tree,suffix array,local sensitive hashing等技术,是做新一代测序技术的assembly、mapping的基础。
作者: zouquan    时间: 2011-7-18 20:16
terence 发表于 2011-7-18 19:07
我也来推荐三本,一本waterman的《Introduction to Computational Biology》,水侠在序列分析领域做了非常多 ...

赞,上学的时候看过前2本,不过只是蜻蜓点水。有些难,呵呵

不过follow Durbin和Li Heng确实大有作为!
作者: xmubingo    时间: 2011-7-20 08:31
提供《基础生物信息学及应用》《生物信息学札记(第3版)》下载

http://59.77.16.75/documentation/




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