机器学习和生物信息学实验室联盟
标题:
如何在NCBI下载一个物种的EST序列
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作者:
zouquan
时间:
2011-10-28 21:27
标题:
如何在NCBI下载一个物种的EST序列
EST是什么,自己去baidu,简单说来就是一段DNA序列,由全世界的科研工作者无组织无纪律瞎测,测完上传汇总在一起,每一条不靠谱的序列就称为一段EST序列。EST一般长为300-800bp。
如何得到某一个物种,比如甜瓜(cucumis melo)的所有EST序列?
首先,去NCBI(
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
),在
EST数据库
中搜索
cucumis melo
[attach]241[/attach]
得到的结果中 Send to
File,
如果选Fasta,则保存的是Fasta格式的序列,如果选EST,则保存的是标准格式的EST序列(带注释)
[attach]242[/attach]
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