机器学习和生物信息学实验室联盟

标题: CUDA在生物信息学上的应用 [打印本页]

作者: xmubingo    时间: 2012-4-8 15:00
标题: CUDA在生物信息学上的应用
本帖最后由 xmubingo 于 2012-4-8 15:00 编辑

http://www.nvidia.com/object/tesla_bio_workbench.html

Molecular Dynamics & Quantum Chemistry
  • ACEMD
  • AMBER
  • BigDFT (ABINIT) (news)
  • GROMACS
  • HOOMD
  • LAMMPS
  • NAMD
  • TeraChem (Quantum Chemistry)
  • VMD

Bio Informatics
  • CUDA-BLASTP
  • CUDA-EC
  • CUDA-MEME
  • CUDASW++ (Smith-Waterman)
  • DNADist
  • GPU Blast
  • GPU-HMMER
  • HEX Protein Docking
  • Jacket (MATLAB Plugin)
  • MUMmerGPU
  • MUMmerGPU++
  • SARUMAN
  • SeqNFind
  • UGENE
作者: zouquan    时间: 2012-4-27 11:13
http://eudoxus.cheme.cmu.edu/gpublast/gpublast.html

GPU-BLAST, 有兴趣的同学可以下载下来试试,如果提供源代码还可供大家学习




欢迎光临 机器学习和生物信息学实验室联盟 (http://123.57.240.48/) Powered by Discuz! X3.2