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标题: Java处理DNA数据的软件包 [打印本页]

作者: zouquan 时间: 2012-7-6 23:59
标题: Java处理DNA数据的软件包
1. JAligner
http://jaligner.sourceforge.net/
实现了最基本的基于动态规划的比对方法，包括DNA和蛋白质，基础

2. Picard
http://picard.sourceforge.net/
可以处理SAM file，日后处理大规模测序数据必不可少

3. Hadoop-BAM
http://sourceforge.net/projects/hadoop-bam/

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