机器学习和生物信息学实验室联盟

 找回密码
 注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
查看: 7686|回复: 0
打印 上一主题 下一主题

如何在NCBI下载一个物种的EST序列

[复制链接]
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2011-10-28 21:27:47 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
EST是什么,自己去baidu,简单说来就是一段DNA序列,由全世界的科研工作者无组织无纪律瞎测,测完上传汇总在一起,每一条不靠谱的序列就称为一段EST序列。EST一般长为300-800bp。

如何得到某一个物种,比如甜瓜(cucumis melo)的所有EST序列?

首先,去NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),在 EST数据库 中搜索 cucumis melo


得到的结果中 Send to File, 如果选Fasta,则保存的是Fasta格式的序列,如果选EST,则保存的是标准格式的EST序列(带注释)

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?注册

x
分享到:  QQ好友和群QQ好友和群 QQ空间QQ空间 腾讯微博腾讯微博 腾讯朋友腾讯朋友
收藏收藏 转播转播 分享分享
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

机器学习和生物信息学实验室联盟  

GMT+8, 2024-11-23 05:09 , Processed in 0.070158 second(s), 23 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表