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GeneID,基因组注释软件

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发表于 2014-4-11 01:09:51 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
http://genome.crg.es/software/geneid/index.html

使用方法:下载下来,在linux服务器上make一下就行,很好用。
使用语句:bin/geneid -AP param/wheat.param genome.fa >protein.fa

具体参数(比如-A)可以-h看
但值得注意的是,-P 必须有,必须要输入参数,软件自带了几个参数文件,有人、鱼、疟原虫、小麦、果蝇、细菌等,没有default,自己选一个。

输出的文件不是fasta,多了一些注释信息

总之很好用,准不准就不知道了
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