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Java处理DNA数据的软件包

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发表于 2012-7-6 23:59:03 | 只看该作者回帖奖励

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1. JAligner
http://jaligner.sourceforge.net/
实现了最基本的基于动态规划的比对方法，包括DNA和蛋白质，基础

2. Picard
http://picard.sourceforge.net/
可以处理SAM file，日后处理大规模测序数据必不可少

3. Hadoop-BAM
http://sourceforge.net/projects/hadoop-bam/

数据, 软件包, Java

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