机器学习和生物信息学实验室联盟

 找回密码
 注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
查看: 2828|回复: 1
打印 上一主题 下一主题

CUDA在生物信息学上的应用

[复制链接]
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2012-4-8 15:00:17 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 xmubingo 于 2012-4-8 15:00 编辑

http://www.nvidia.com/object/tesla_bio_workbench.html

Molecular Dynamics & Quantum Chemistry
  • ACEMD
  • AMBER
  • BigDFT (ABINIT) (news)
  • GROMACS
  • HOOMD
  • LAMMPS
  • NAMD
  • TeraChem (Quantum Chemistry)
  • VMD

Bio Informatics
  • CUDA-BLASTP
  • CUDA-EC
  • CUDA-MEME
  • CUDASW++ (Smith-Waterman)
  • DNADist
  • GPU Blast
  • GPU-HMMER
  • HEX Protein Docking
  • Jacket (MATLAB Plugin)
  • MUMmerGPU
  • MUMmerGPU++
  • SARUMAN
  • SeqNFind
  • UGENE
分享到:  QQ好友和群QQ好友和群 QQ空间QQ空间 腾讯微博腾讯微博 腾讯朋友腾讯朋友
收藏收藏 转播转播 分享分享
回复

使用道具 举报

沙发
发表于 2012-4-27 11:13:49 | 只看该作者
http://eudoxus.cheme.cmu.edu/gpublast/gpublast.html

GPU-BLAST, 有兴趣的同学可以下载下来试试,如果提供源代码还可供大家学习
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

机器学习和生物信息学实验室联盟  

GMT+8, 2024-11-3 04:28 , Processed in 0.066047 second(s), 19 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表