机器学习和生物信息学实验室联盟

标题: GeneID，基因组注释软件 [打印本页]

作者: zouquan 时间: 2014-4-11 01:09
标题: GeneID，基因组注释软件
http://genome.crg.es/software/geneid/index.html

使用方法：下载下来，在linux服务器上make一下就行，很好用。
使用语句：bin/geneid -AP param/wheat.param genome.fa >protein.fa

具体参数（比如-A）可以-h看
但值得注意的是，-P 必须有，必须要输入参数，软件自带了几个参数文件，有人、鱼、疟原虫、小麦、果蝇、细菌等，没有default，自己选一个。

输出的文件不是fasta，多了一些注释信息

总之很好用，准不准就不知道了

欢迎光临机器学习和生物信息学实验室联盟 (http://123.57.240.48/)