机器学习和生物信息学实验室联盟
标题:
服务器安装软件
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作者:
zouquan
时间:
2016-5-5 23:07
标题:
服务器安装软件
1. Java环境:
版本:jdk1.8.0_65
路径:/usr/local/src/jdk1.8.0_65
2. Tomcat:
版本:apache-tomcat-8.0.28
路径:/usr/local/src/tomcat
3. Blast
版本:blast-2.2.21
路径:/usr/local/src/blast-2.2.21
4. Blast+
版本:ncbi-blast-2.2.28+
路径:/usr/local/src/ncbi-blast-2.2.28+
5. RNAfold
版本:ViennaRNA-1.6.1
路径:/usr/local/src/ViennaRNA-1.6.1 /usr/local/bin
6. psipred
没写到系统变量中?
版本:psipred3.3
路径:/usr/local/src/psipred3.3
7. R
版本:R-3.2.5
路径:/usr/local/src/R-3.2.5
其他我用apt-get安装的有:unzip(160506),gfortran(160516), libreadline6-dev(160516), libxt-dev(160516), yum(160516), screen(160601)
作者:
zouquan
时间:
2016-6-1 15:17
20160601,将java写到系统变量,所有用户都可以用java了。
在/etc/profile 文件的最后添加
export JAVA_HOME=/usr/local/src/jdk1.8.0_65
export PATH=$PATH:/usr/sbin:$JAVA_HOME/bin
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/jre/lib:$JAVA_HOME/lib:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
然后运行 #source /etc/profile
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