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读fasta格式文件的java程序

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楼主
发表于 2011-4-24 17:20:22 | 只看该作者 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式
虽然读fasta文件很简单,但要考虑到到处都可能有多加入的回车,事实上编写程序也不容易

附件代码,不但读入fasta序列,而且把多余的空格、数字删除掉了

如果在使用过程中,还想删除其他特殊字符,修改程序便可

程序用Jbuilder2006写的

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板凳
 楼主| 发表于 2013-6-20 02:22:36 | 只看该作者
计算n50的perl代码(可在linux下运行)

计算fasta文件最长长度最短长度和平均长度的java程序(我写的,jar,可在linux运行)

运行方法都是程序后加fasta文件名

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沙发
发表于 2011-4-24 22:00:14 | 只看该作者
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