机器学习和生物信息学实验室联盟

 找回密码
 注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
查看: 3556|回复: 2
打印 上一主题 下一主题

读fasta格式文件的java程序

[复制链接]
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2011-4-24 17:20:22 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
虽然读fasta文件很简单,但要考虑到到处都可能有多加入的回车,事实上编写程序也不容易

附件代码,不但读入fasta序列,而且把多余的空格、数字删除掉了

如果在使用过程中,还想删除其他特殊字符,修改程序便可

程序用Jbuilder2006写的

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?注册

x
分享到:  QQ好友和群QQ好友和群 QQ空间QQ空间 腾讯微博腾讯微博 腾讯朋友腾讯朋友
收藏收藏 转播转播 分享分享
回复

使用道具 举报

沙发
发表于 2011-4-24 22:00:14 | 只看该作者
提示: 该帖被管理员或版主屏蔽
回复 支持 反对

使用道具 举报

板凳
 楼主| 发表于 2013-6-20 02:22:36 | 只看该作者
计算n50的perl代码(可在linux下运行)

计算fasta文件最长长度最短长度和平均长度的java程序(我写的,jar,可在linux运行)

运行方法都是程序后加fasta文件名

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?注册

x
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

机器学习和生物信息学实验室联盟  

GMT+8, 2024-11-27 05:52 , Processed in 0.066295 second(s), 18 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表