林伟20160722: 一种基于网络的全基因组关联分析的方法

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标题: 一种基于网络的全基因组关联分析的方法

分享人: 林伟

摘要:

通过增加基因表达数据以及提出一种基于网络的分析方法来更好地解决由基因型到表型间的关联分析;
在所构建的网络中, 点由基因型数据(SNP), 基因表达数据以及表型数据构成; 而其中的边权重大小则表示点之间关联的可靠性。
基因型到表型所经过的所有边构成了一条带权路径,其中所有边权重的乘积大小可用于衡量二者间关联的可靠性;
在模拟数据的分析结果上, 相同的假阳率下, 该方法较传统方法能检测到更多的与表型关联的SNP;
在真实数据的分析结果上, 该方法得到的结果也具有一定的生物学意义。

创新点:
(1) 利用了基因表达数据;
(2) 提出了一种新方法;

论文:
[1] Lee S, Kong S, Xing E P. A network-driven approach for genome-wide association mapping[J]. Bioinformatics, 2016, 32(12): i164-i173.

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